公司向自然人股东无偿借款，即未收取利息的情况，虽然看似简化了财务管理，但在税务层面却潜藏着一定的风险和复杂性，主要体现在以下几个方面：
企业所得税：如果企业向股东提供了无息贷款，税务局可能会质疑这笔款项的真实性质，认为这是一种变相的利润分配，而非真正的借贷。在这种情况下，税务局可能会将这部分款项视为隐性分红，要求公司补缴企业所得税。此外，这还可能导致额外的罚款和滞纳金。
个人所得税：对于接受借款的自然人股东而言，收到的无息贷款可能被视为一种福利或收益，从而触发个人所得税的征收。根据所在国家或地区的税法，这可能被认定为“利息收入”或是“赠予”，股东需要为此支付相应税款。
增值税：尽管直接提供无息贷款本身通常不产生增值税义务，但如果存在任何形式的间接报酬或补偿，例如通过服务或其他方式抵消债务，那么可能就会涉及增值税问题。
关联交易：如果借款行为构成了关联交易，尤其是在跨国集团间，那么必须遵循转移定价规则，确保交易条件与独立第三方之间的交易相似，否则可能会受到税务机关的审查，甚至面临调整价格的风险。
注册资本和财务结构：频繁或大量的无息借款可能会影响公司的资产负债表和财务比率，引发银行、投资者或债权人对公司财务健康状况的担忧。
为了避免潜在的税务风险，企业应该考虑以下几点：
设立合理的借款协议：即使借款无需支付利息，也应该签署正式的借款协议，明确还款期限、用途、违约条款等，以显示借款的真实意图。
利息公允性：即使决定不收取利息，也可以设定一个象征性的低利率，接近同期银行贷款利率，减少税务局的关注。
资金往来透明化：确保所有借款记录清晰，有完整的银行流水和其他交易凭据，便于证明借款的目的和偿还路径。
专业咨询：寻求会计师或税务专家的意见，以确保操作符合当地的法律法规，最大限度地规避税务风险。
最终，每项具体的税务政策和实践都可能因地区而异，因此，任何决策之前都应该详细了解并遵循当地税务部门的指导原则。
